为进一步落实预存征地补偿款制度，建立预存征地补偿款良好运行秩序，促进征地补偿安置工作顺利开展，市局研究制定了市本级预存征地补偿款运作程序暂行规定，该暂行规定日前经市政府批转实施。

结合南京实际，规定明确：作为征地主体的各区人民政府、四大开发区管委会、市土地储备中心及承担公益性事业项目建设等单位，为预存征地补偿款的四大出资主体。根据规定中明确的征地补偿款预存、征地补偿款预拨的工作流程：一是市国土局接到申报项目后，在正式报批前向征地报批主体开具“预存征地补偿款缴款通知书”，征地报批主体到市国土局申报项目后，在正式报批前开具“预存征地补偿款缴款通知书”，报批主体根据通知书交存补偿款后方可办理报批手续。二是征地项目经有权部门批准后，征地服务机构按照相关规定和管理程序，签订征地补偿安置等协议，并按要求填写“征地补偿款预拨申请单”，经市国土局批准后办理预拨款手续。此外，规定还对征地补偿款结算和征地补偿款计息的具体方式予以明确。